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단일 세포 단위 시교차상핵 유전자 발현량 오믹스 자료 분석 최초 분석결과 공개


제목

​단일 세포 단위 시교차상핵 유전자 발현량 오믹스 자료 분석 최초 분석결과 공개

추천 연구 논문

Spatiotemporal single-cell analysis of gene expression in the mouse suprachiasmatic nucleus. Nat Neurosci 23, 456–467 (2020). (https://doi.org/10.1038/s41593-020-0586-x)

선정 이유

생체시계 관련 오믹스 분야에서 최초의 단일 세포 오믹스 자료를 생성한 랜드마크 연구자료

주요 내용

(1) 시교차상핵에서의 세포 유형별 24시간 주기를 가지는 유전자의의 발현량을 단일 세포 수준에서 최초로 프로파일링 함. (2) 시교차상핵의 세포 유형을 분류한 결과 총 8가지 유형의 다른 세포로 구분되었으며, 각 세포 유형 특이적인 생체시계 주기성 유전자를 신규 규명함. (3) 시교차상핵 신경 세포의 하위 유형 분류하였으며, 총 5개의 시교차상핵 신경세포의 하위 유형을 최초 규명함 (Avp+/Nms+, Vip+/Nms+, Cck+/C1ql3+, Grp+/Vip+, Cck+/Bdnf+neuron) (4) 세포 유형 별 이질성을 가지는 일주기 유전자 신규규명 및 시교차상핵 신경 세포의 하위 유형별 분석을 통해 시교차상핵 신경 세포의 하위 유형들 사이의 관계성에 대해서 추론함. 특히, Grp+/Vip+ subtype 이 빛에 반응하는 세포임을 최초 시사함. (5) 시교차상핵 신경 세포의 하위 유형에 따라 시교차상핵에서 구조적으로 농축된 부분이 있음을 최초 확인함.

시사점

(1) 시교차 상핵의 유전자 조절의 시공간적 패턴은 24시간 주기성 조절에 중요한 역할을 가질 것임. 하지만, 시교차상핵의 세포 유형 및 각 기능은 불명확함. 따라서, 신경세포의 하위 유형의 기능들에 대해 가설을 제시함. (2) 특정 신경 세포 하위 유형 3가지 사이에 시너지가 있음을 시사함 (Vip+/Nms+,Avp+/Nms+, Cck+/C1ql3+). (3) 시교차상핵 신경세포의 하위 유형들이 뇌의 다른 영역과 어떻게 상호작용하는지, 다른 신경 기능을 어떻게 수행하는지, 조절 메커니즘 등 기존 연구에 비해 단일 세포 수준에서의 결과를 최초로 제시함. (4) 생체시계 관련 오믹스 자료 중 단일세포 오믹스 기술을 최초로 도입한 연구인 만큼, 많은 내용에 대해 검증이 필요하며, 해당 공개된 자료의 재분석을 통해서 새롭게 밝혀낼 수 있는 사실이 많을 것임.


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