제목 | 단일 세포 단위 시교차상핵 유전자 발현량 오믹스 자료 분석 최초 분석결과 공개 |
추천 연구 논문 | Spatiotemporal single-cell analysis of gene expression in the mouse suprachiasmatic nucleus. Nat Neurosci 23, 456–467 (2020). (https://doi.org/10.1038/s41593-020-0586-x) |
선정 이유 | 생체시계 관련 오믹스 분야에서 최초의 단일 세포 오믹스 자료를 생성한 랜드마크 연구자료 |
주요 내용 | (1) 시교차상핵에서의 세포 유형별 24시간 주기를 가지는 유전자의의 발현량을 단일 세포 수준에서 최초로 프로파일링 함. (2) 시교차상핵의 세포 유형을 분류한 결과 총 8가지 유형의 다른 세포로 구분되었으며, 각 세포 유형 특이적인 생체시계 주기성 유전자를 신규 규명함. (3) 시교차상핵 신경 세포의 하위 유형 분류하였으며, 총 5개의 시교차상핵 신경세포의 하위 유형을 최초 규명함 (Avp+/Nms+, Vip+/Nms+, Cck+/C1ql3+, Grp+/Vip+, Cck+/Bdnf+neuron) (4) 세포 유형 별 이질성을 가지는 일주기 유전자 신규규명 및 시교차상핵 신경 세포의 하위 유형별 분석을 통해 시교차상핵 신경 세포의 하위 유형들 사이의 관계성에 대해서 추론함. 특히, Grp+/Vip+ subtype 이 빛에 반응하는 세포임을 최초 시사함. (5) 시교차상핵 신경 세포의 하위 유형에 따라 시교차상핵에서 구조적으로 농축된 부분이 있음을 최초 확인함. |
시사점 | (1) 시교차 상핵의 유전자 조절의 시공간적 패턴은 24시간 주기성 조절에 중요한 역할을 가질 것임. 하지만, 시교차상핵의 세포 유형 및 각 기능은 불명확함. 따라서, 신경세포의 하위 유형의 기능들에 대해 가설을 제시함. (2) 특정 신경 세포 하위 유형 3가지 사이에 시너지가 있음을 시사함 (Vip+/Nms+,Avp+/Nms+, Cck+/C1ql3+). (3) 시교차상핵 신경세포의 하위 유형들이 뇌의 다른 영역과 어떻게 상호작용하는지, 다른 신경 기능을 어떻게 수행하는지, 조절 메커니즘 등 기존 연구에 비해 단일 세포 수준에서의 결과를 최초로 제시함. (4) 생체시계 관련 오믹스 자료 중 단일세포 오믹스 기술을 최초로 도입한 연구인 만큼, 많은 내용에 대해 검증이 필요하며, 해당 공개된 자료의 재분석을 통해서 새롭게 밝혀낼 수 있는 사실이 많을 것임. |
RLRC 생체시계-항노화 융합
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