마우스 간에서의 일주기 시계 연관 단백체 지도 작성

제목	마우스 간에서의 일주기 시계 연관 단백체 지도 작성
추천 연구 논문	A proteomics landscape of circadian clock in mouse liver. Nat Commun. 2018 9(1):1553. (doi: 10.1038/s41467-018-03898-2)
선정 이유	일주기 관련 체내 기관(organ)으로서, 간은 일주기 시계(circadian clock)의 다른 phases 에서 다양한 기능을 수행함. 이러한 생체 과정은 transcription program 에 의해서 조절된다고 가정하고 있음. 본 논문에서는 transcription factor 단백질의 DNA-결합 활성를 기반으로 하는 다차원적(multi-dimensional) 단백체학 기법을 통해서 마우스 간의 단백체 지도를 처음으로 작성하였다는 점에서 본 논문을 선정함.
주요 내용	- 본 논문은 label-free 질량분석 기반의 단백체학 기법을 이용하여 일주기 시계에 따른 마우스 간 조직에서의 단백체 분석연구를 수행하였음. - 이 지도에서는 간 조직의 계층적 일주기 시계 네트워크를 나타내기 위해서, 전사체 뿐만 아니라. 다른 transcription factor 단백질들의 DNA-binding 프로파일들, phosphorylation 와 ubiquitylation 패턴들, 세포핵 내 단백체, 전체 단백체들 정보가 포함되어 있음. - DNA-결합 활성 결과는 크게 네 가지 생체경로들(the immune response, glucose metabolism, fatty acid metabolism, and the cell cycle)에서 diurnal oscillation 이 일어나는 것을 보여줌. - 또한 본 논문에서는 마우스 간 Kupffer 세포만 isolation 하고 일주기 cycle 동안 이 세포에서 발현된 단백체를 측정함으로써, 세포 타입별 일주기 시계를 규명하였음.
시사점	이와 같은 종합적인 단백체 데이터 세트들은 일주기 시계와 관련하여 마우스 간의 생리를 이해하기 위한 풍부한 데이터 리소스를 제공함.